1、廉租房只租不售，而商品房不受。廉租房面向城市特困人口出租，只收取象征性的房租；而商品房由房地产开发经营公司向机关单位租用土地使用权期限40年、50年、70年开发的房屋，建成后就面向市场所有购房人群。
2、性质不同。商品房是由房地产开发经营公司向机关单位租用土地使用权期限40年、50年、70年开发的房屋，建成后用于市场出售出租的房屋。而廉租房则为解决低收入家庭的基本居住问题所提供的性住房。表现形式有差异。廉租房一般有两种表现形式，一是由出资建好后，低租金给住房困难户；二是由发放租金补贴给住房困难户，由他们租赁社会房屋居住。公租房一般是出资建房，低租金租给租户。
3、缴纳租金不同。一般情况下，廉租房要比公租房的租金要低上很多。廉租房月租金标准约为0．8－1．2元／平方米。而商品房则不需要缴纳租金，购房者在购买商品房后就享有商品房的所有权，能自由处置房产。
商品房是指经有关部门批准，由房地产开发经营公司向机关单位租用土地使用权期限40年、50年、70年开发的房屋，建成后用于市场出售出租的房屋，包括住宅、商业用房以及其他建筑物。商品房又称“大产权房”。
廉租房是指以租金补贴或实物配租的方式，向符合城镇居民最低生活保障标准且住房困难的家庭提供社会保障性质的住房。廉租房的分配形式以租金补贴为主，实物配租和租金减免为辅。根据住房和城乡建设部、财政部、国家发展和改革委员会联合印发的《关于公共租赁住房和廉租住房并轨运行的通知》（建保〔2013〕178号）的规定，从2014年起，各地公共租赁住房和廉租住房并轨运行，并轨后统称为公共租赁住房。